1、基于寬帶薪酬的薪酬變動性
寬帶薪酬的一個特征是員工的薪資不再是一個準確的點，而是一個非常寬的區間，員工薪資在此區間內根據能力、業績和資歷浮動。由此，使人工成本的預算和控制成為非常困難的事，尤其是當員工保持一定水平的流動時。
2、公司整體業績與部門業績的差異
一方面公司整體業績會受到外部市場環境的影響，而部門業績則是以公司內部計劃目標為標準，所以公司業績與部門業績總會出現差異。另一方面有些屬于支撐和職能性的部門，其業績和工作量并不嚴格隨公司經營情況而浮動，例如行政后勤部門、研發部門、財務部門、人力資源部門等。
這就造成依據公司整體業績的人工成本控制和基于部門業績的薪酬激勵的矛盾。例如，當公司整體業績不佳、業務較少的時候，行政后勤部門的工作并沒有減少太多，部門業績也基本不會受到影響。根據人工成本預算控制的要求，行政后勤部門的薪資也應當隨著公司業績而減少，但行政后勤部門的工作量即沒有降低多少，工作業績也沒有變化多少，無端根據公司業績調整其報酬，不僅會讓員工心生不滿，而且也不符合薪酬根據業績發放的激勵原則。
3、價值鏈各環節價值創造的時間差異
人工成本預算控制的依據通常是產值、收入或者利潤，但價值鏈上各環節創造價值卻并非同時完成，而是存在一定的時間差。一般情況下，是沿著研發→采購→生產→物流→銷售的路徑順序進行。當產品生產入庫時，銷售收入還沒有實現;或者剛好相反，銷售收入實現的時候，產品還沒有被生產出來。這就造成依據收入核算的人工成本與生產部門實際創造的價值不相匹配，即或者收入高的時候產值卻低，或者收入低的時候產值高，這樣就使得依據收入確定的人工成本顯得不盡合理。
4、外部環境突變造成預算失真
人工成本預算的前提是公司的經營環境和技術水平相對穩定，但愈來愈多的外部環境突變卻讓人工成本預算控制失去意義。例如，市場的突然向好使得員工并未付出額外努力而公司業績卻大幅增加，此時按照人工成本預算控制的規則支付薪酬又有何激勵作用呢?同樣的道理，如果是因為公司投入資金進行技術改造使得產值或者利潤大幅度增加，那么據此增加人工成本預算又怎么能稱得上合理呢?