園藝科學與工程學院具有光輝的辦學歷史，最早可追溯到1946年山東大學農學院園藝系(青島)和1947年山東農學院園藝系(濟南)，1952年全國院系調整，金陵大學園藝系和南京大學園藝系果樹組調入了山東農學院，成立了新的園藝系，1958年隨學校由濟南遷至泰安，2000年12月更名為園藝學院，2004年3月更名為園藝科學與工程學院。
經過60多年的建設與發展，學院已發展成以本科教育為基礎、具有一定規模碩士、博士研究生教育和博士后人員培養的多層次辦學的優勢學院。學院現設有果樹學、蔬菜學、茶學、觀賞園藝、園藝環境工程5個系、1個果樹研究所和1個園藝學實驗中心。
學院有園藝和設施農業科學與工程2個本科專業。園藝專業2002—2005年為全國A++專業，山東省“十五”重中之重建設專業，2007年度國家第二批高等學校特色建設專業。園藝學為一級博士學科授權點，覆蓋果樹學、蔬菜學、茶學、觀賞園藝、園藝環境工程、設施農業科學與工程和葡萄與葡萄酒學7個二級學科博士點。園藝學博士后流動站2005年被評為全國優秀博士后科研流動站。果樹學為國家級重點學科，果樹學、蔬菜學為山東省重點學科，隸屬作物生物學國家重點實驗室，果樹生物學實驗室為山東省重點實驗室。以學院為依托建立了國家蘋果工程技術研究中心、山東省蘋果工程技術研究中心、山東農業大學果樹研究所和山東農業大學設施園藝研究所。
學院現有教職員工80人，其中中國工程院院士1人，“泰山學者”特聘教授崗位2個，博士導師 16人，碩士生導師35人，教授23人，副教授22人，教學科研人員博士率達75%以上，博士后研究經歷者13人。學院師資學歷水平高，研究實力雄厚，教育教學水平高，其中霍英東教育基金教學獎獲得者2人、享受國務院政府津貼3人、山東省十大優秀教師2人、山東省教學名師2人、山東省有突出貢獻的中青年專家1人，多人次獲得山東農業大學優秀教學質量獎一等、二等獎、學生心目中的十大優秀教師等榮譽稱號。2008年將園藝專業建設成為“國家級第一類特色專業”，普通園藝學建設成為“國家級精品課程”。園藝本科專業教學團隊建設成為“省級教學團隊”，新上2項國家級教研課題，4部教材被列入國家規劃教材，其中主編2部，副主編2部。目前學院在校本科學生1200余人，博士研究生40余人，碩士研究生200余人，專業學位碩士70余人。
近五年來學院教師承擔國家863、973、國家自然科學基金、國家跨越計劃、國家科技攻關、國家科技成果轉化基金、國家948、國家科技支撐計劃、國際合作項目等以及山東省科技廳、教育廳、山東省自然基金等項目100余項。主編和參編全國編教材和面向21世紀系列教材10多部，取得國家級教學成果4項、省級教學成果6項，獲國家及省部級科技進步獎17項，發表學術論文800余篇，SCI收錄70余篇，成果轉化創造社會經濟效益近300億元，為山東乃至全國的園藝產業發展做出了巨大貢獻。
學院實驗中心儀器、設備精良。利用“八五”、“九五”重點學科、“十五”重點建設、博士后流動站建設、省部共建、國家財政部等資助資金，購進一大批具有國際先進水平的儀器設備，總值已達1620萬余元，大型精密儀器設備值860多萬元。先進的儀器設備，為教師、博士、碩士研究生完成高水平的研究工作提供了物資保障。學院下屬園藝教學實驗站，占地140余畝，有現代化的溫室、大棚、日光溫室等設施，果、菜、花、茶名貴品種資源300余種，為學生學習、研究和教師科研提供了大量素材和便利條件。
學院與美國的肯塔基大學農學院、康奈爾大學、維斯康星大學、日本的千葉大學、大阪府立大學、靜岡大學、法國昂熱農學院、加拿大農業部馬鈴薯研究中心、韓國的首爾大學、公州大學、慶尚大學等建立了長期的合作關系，為進一步加強學術交流和人才培養、提高研究水平和人才素質、促進園藝學科又好又快地發展創造了良好的平臺。