應用化學專業于1992年獲江蘇省教委批準設立，1993年正式開始招收本科生。2002年化學與環境科學學院成立，隨后在原有機化學、應用化學和高分子化學教研室基礎上成立了應用化學系。
近年來，應用化學系圍繞學科發展方向和人才培養需要，建設了一支學歷層次高，整體科研和教學能力強，年齡結構、學歷結構、職稱結構合理，朝氣蓬勃、富于創新的學術隊伍。本系現有教師20人，其中教授7人，副教授9人。教師中17人擁有博士學位，多人具有在國(境)外知名大學或研究機構從事合作研究、訪問研究或攻讀學位的經歷。并有江蘇省“333”工程培養對象1人，省“優秀中青年骨干教師”1人。
本系擁有有機化學、應用化學和高分子化學3個碩士學位點。為了對高水平科學研究和創新人才培養提供有力的支撐，圍繞主要研究方向，以本系教師為骨干力量，成立了江蘇省生物功能材料重點實驗室、江蘇省生物醫藥功能材料工程研究中心和江蘇省萃取分離工程研究中心等科研基地和研究開發機構，團隊聯合研究的態勢已基本形成。主要研究方向包括生物功能材料、醫用材料、光電材料、有機合成方法學以及萃取分離方法等。目前實驗室總建筑面積達4千平方米，設備總值近千萬元人民幣。近3年來本系教師主持國家自然科學基金面上項目5項，江蘇省科技轉化基金項目2項，省自然科學基金面上項目多項，并承擔地方和企業的重大技術開發項目總計超過1000萬元。近年來在包括Chem. Rev.、Langmuir、Chem. Commun.、Adv. Func. Mater.等國際權威期刊在內的國內外專業期刊發表論文多篇，獲發明專利授權數十項�？萍嫁D化項目取得產值超億元人民幣。
應用化學本科專業設有化工過程與工藝、材料合成與工藝、精細化工、高分子材料、有機合成、材料化學等專業方向，目標為適應本省社會經濟發展的需求，培養既有扎實化學化工專業基礎，又有較強實踐和應用能力的高層次人才。畢業生主要就業于省內外化工以及相關企業。由于綜合優勢較為明顯，因此畢業生在社會上有較強的競爭力，受到用人單位的普遍好評。