計算數學碩士點于1986年獲得碩士學位授權，計算數學碩士點于2006年獲得博士學位授權。計算數學是原江蘇省教委重點學科。
研究生開設的主要課程有：泛函分析、矩陣計算、力學中的數學方法、高等數值分析、偏微分方程數值解、有限元方法數學理論、偏微分方程、連續介質力學、矩陣迭代分析、最優化理論與方法、非線性方程組迭代解、廣義逆矩陣引論、并行計算、區域分解與多重網格、多尺度分析與多尺度算法、邊界元方法的數學理論、辛幾何算法、代數—微分方程、變分不等式與互補問題等。主要研究方向：最優化理論與方法、數值代數、偏微分方程數值解，等。研究的特色主要體現如下方面：(i) 圍繞科學與工程計算中的前沿問題進行研究，饒有建樹;(ii) 注重科學與學與工程計算中大規模計算的理論性研究，形成了一些原創性理論;(iii) 研究科學與學與工程計算中的高性能算法，并取得了一系列有影響的研究成果。2000年以來承擔省部級以上科研項目30余項，其中國家自然科學基金10余項，國家973項目的子項目4項，等等。每年發表高水平論文40余篇，一半以上為學術榜論文。“科學工程計算中高性能算法的研究”2006年獲得了江蘇省科技進步二等獎。
本學位點教授6人，副教授7人，擁有博士學位者10人。博士生導師主要有宋永忠、孫文瑜、陳金如、杜其奎、朱慶保等5人，碩士生導師主要有宋永忠、孫文瑜、陳金如、杜其奎、朱慶保、王雨順、張志躍、王麗、陳新、韓德仁等10人。是一支實力雄厚、結構合理，團結協作、思想活躍的高水平隊伍。近幾年來這支隊伍一直活躍在計算數學主要研究方向的前沿，如在大規模優化的理論與算法、數值并行算法、復合材料的多尺度算法、電磁場的分析與數值模擬、發展方程的自然邊界歸化與邊界元方法等方面，取得了一些高水平成果，受到國內外同行及專家學者的關注。
宋永忠教授為國家“百千萬工程”第一、二層次培養對象，江蘇省“333工程”第二層次培養對象，江蘇省跨世紀學術帶頭人培養人選，江蘇省有突出貢獻的中青年專家，江蘇省優秀科技工作者，江蘇省優秀研究生導師，《高等學校計算數學學報》編委，并與德國卡爾斯魯厄大學和洪堡大學建立了穩定的合作研究和定期互訪學術交流關系，在國內外具有一定的影響。孫文瑜教授先后被聘為澳大利亞新南威爾士大學、墨爾本大學，加拿大Leakhead大學，巴西巴拉那聯邦大學、巴西利亞國立大學、巴西天主教大學，新加坡國立大學等大學客座教授。陳金如教授師從復旦大學李立康教授獲博士學位，在中科院計算數學所與崔俊芝院士合作完成博士后研究工作，曾參加國家“973”“大規�？茖W計算研究”項目，為江蘇省學術帶頭人培養人選。杜其奎教授師從中科院計算數學所余德浩教授獲博士學位，在發展方程的自然邊界歸化與邊界元方法等方面取得豐富成果，拓廣了自然邊界方法的應用領域。
利用“211工程”建設的契機，在原有的科學與工程計算實驗室的基礎上，進一步提升了實驗室的配置，建成了可擴充的24結點的集群式并行計算實驗室，為大規�？茖W工程計算提供了強有力的實驗條件。
計算數學專業研究生培養的目標是：掌握本學科堅實的基礎理論、系統的專業知識，掌握相應的技能、方法和相關知識，具有獨立的從事本專業實際工作和科學研究工作的能力，具有創新和創業精神。畢業生可在科研院所、大專院校、經濟部門和公司企業從事信息與計算機科學的研究、教學、應用軟件設計開發和經營管理工作。