企業在編制薪酬預算時，首先應該對公司面臨的內部條件和外部環境有充分掌握和分析，這樣可以清楚地知道企業目前的狀況、競爭對手的動向以及面臨的挑戰和機遇。只有這樣，才能比較準確的預算需要支出的人工成本。
企業常用的薪酬預算方法有自上而下、自下而上以及這兩種方法的綜合應用。
(一) 自上而下法
自上而下法是通過對企業經營數據(銷售收入、企業增加值等)做出預測，結合人工成本歷史數據，分析企業面臨的環境和條件，對年度人工成本做出預測，并將人員配置及人工成本分配到各部門。
(二) 自下而上法
自下而上法是各部門根據企業制定的經營目標，提出本部門人員配置數量及薪酬水平，人力資源部門根據勞動力市場狀況、企業內部條件、物價上漲水平等各方面因素對薪酬水平的影響，綜合確定公司人均薪酬增長率，依據相關經營數據及各部門提交的建議，確定各部門的人員配置和薪酬水平，通過匯總各部門數據，就可以得出公司整體的薪酬預算。
(三) 綜合法
事實上，企業薪酬管理制度都是自上而下法和自下而上法的結合，只有堅持企業發展戰略導向，將企業目標層層分解，同時充分尊重各級管理者和員工的意見和建議，企業才能對外部環境以及內部條件有更清楚的認識，這樣的預算才更切合實際，才能被廣大員工易于接受和理解，才能得到切實、有效的執行。