吉林大學馬克思主義學院成立于2005年3月。學院是承擔全校本科生、碩士生、博士生三個層次思想政治理論課教學和本學院博士生、碩士生的培養以及馬克思主義理論研究等任務的教學科研單位。2006年，學院獲得首批馬克思主義理論博士點一級學科授予權，2007年，獲準設立馬克思主義理論博士后流動站。學院設立馬克思主義基本原理、馬克思主義發展史、中國化馬克思主義研究、國外馬克思主義研究、思想政治教育、中國近現代史基本問題研究等6個二級學科博士點，設立馬克思主義基本原理、馬克思主義發展史、中國化的馬克思主義研究、國外馬克思主義研究、思想政治教育、中國近現代史基本問題研究、中共黨史、科學社會主義理論與國際共產主義運動等碩士點。學院現任院長是博士生導師韓喜平教授，現任學院黨委書記是劉昌松副教授。
學院設有馬克思主義基本原理、毛澤東思想和中國特色社會主義理論體系概論、中國近現代史綱要、形勢與政策、思想道德修養與法律基礎、研究生思想政治理論課等6個教研室;另有吉林大學中國特色社會主義理論體系研究中心和吉林大學農村發展研究中心掛靠在本學院。
馬克思主義學院擁有一支年齡學歷結構合理、教學水平高、科研能力強的師資隊伍。全院現有教職工 158人，其中，教授34人，博士生導師17人，副教授43人，具有博士學位和攻讀博士學位的教師93人。學院現擁有“中央馬克思主義理論研究與建設工程”項目首席專家1人、國務院學科評議組成員1人、教育部社科委員2人、教育部新世紀優秀人才1人、全國優秀教師1人、全國優秀政治理論課教師1人、匡亞明特聘教授1人、校內雙聘教授4人。在校研究生444人，其中，博士研究生90人，博士后7人。
為適應建設高水平研究型大學的需要，學院教師嚴謹治學，強化精品意識，在馬克思主義理論研究領域取得了豐碩的研究成果。建院以來，學院教師在《馬克思主義研究》、《哲學研究》、《政治學研究》、《教育學研究》、《吉林大學社會科學學報》、《高校理論戰線》、《人民日報》、《光明日報》《求是》等重要學術期刊上發表論文1052余篇，其中多篇被《新華文摘》、《中國社會科學文摘》等權威學術期刊轉載;出版有關馬克思主義理論研究的著作和教材76部;承擔省部級以上科研課題112項，其中，國家級課題9項，教育部重大課題1項，教育部其他課題17 項，省級課題85項;科研成果獲得國家級和省部級獎勵18項;擁有1門國家級精品課、1門省級精品課、一個省級重點學科和兩個省級教學團隊。一系列具有標志性的科研和教學成果在社會上產生了廣泛和重大的影響。