2005年初，中國地質大學(武漢)的一批專家基于目前國家能源勘查的緊迫形勢，適時地提出了建立“煤及煤層氣工程專業”的設想。該建議迅速地得到了教育部的高度重視，經過周密論證該專業于2005年獲教育部批準，2006年3月10日正式公布，編號為080108S。從此，中國地質大學(武漢)成為國內第一個承辦該專業的高等院校。
新專業建設得到了學校各級領導、職能部門及兄弟院系的大力支持。2007年3月，學校批準在資源學院成立煤及煤層氣工程系，簡稱“煤工系”。煤工系主要負責和組織承辦煤及煤層氣工程專業。本專業旨在培養學生，在牢固掌握自然基礎科學知識的基礎上，系統學習煤及煤層氣資源勘查和開發工程的基礎理論和基本知識，掌握與煤及煤層氣地質學研究及資源勘查和綜合評價有關的基本技能與方法。本專業將在煤及煤層氣地質基礎、煤層氣勘探與開發工程、煤綜合利用與環境保護、煤層瓦斯治理與煤礦安全等方面有所側重。同時，煤工系還招收礦產普查與勘探、能源地質工程等學科方向的碩士和博士研究生。
煤及煤層氣工程專業是一個具有悠久歷史的新專業，它是具有幾十年雄厚知識積淀的前煤田地質學專業的延續與再生。幾十年來，中國地質大學培養的煤田地質人才質量在國內首屈一指。雖然在20世紀90年代煤田地質專業被取消并調整歸屬于資源類大專業，但是卻保留了無價的辦學經驗和工作作風。出身于煤田地質專業的新一代中青年教師，在經歷了改革開放尤其是通過在相關領域的艱苦磨練，如今的知識面得到大大拓寬，為新專業的承建帶來了無限的活力和境界。目前，新專業與學科建設真正體現了“內聯外合”的辦學思想，在從事本專業教學的在編和兼職師資隊伍中，有教授 14人，博士生導師10人，楚天學者1名，副教授3人，講師4人，平均年齡42歲。高級職稱占85%，具有工學碩士學位和工學博士學位的教師占90%。
目前，煤及煤層氣工程系正在執行兩項源于教育部立項的學科與專業建設大型項目。2007年12 月，中國地質大學(武漢)煤及煤層氣工程專業被教育部批準為第一批高等學校特色專業建設點。2007年7月，煤及煤層氣工程新專業教學實驗室建設專項修購計劃獲得教育部批準，該項目支持下的“煤質實驗室”、“煤巖實驗室”、“煤系實驗室”、“煤儲層實驗室”、“煤層氣成藏實驗室”和“煤層氣工程工藝實驗室”已經開始了合理的規劃和承建。同時，煤及煤層氣工程專業積極聯合社會力量，共同謀劃和籌建教學實習基地。2006年4月10日，與“晉城無煙煤礦業集團有限責任公司”簽署了聯合共建煤層氣開發工程產學研基地的協議，建成了新專業的第一個產學研基地。
煤及煤層氣工程系多年來在煤地質、煤層氣地質、煤儲層和含煤巖系伴生礦產等領域涌現出一批高質量的科研成果。主持了包括國家自然科學基金、國家科技攻關、“973”課題和專題、“863”項目等國家級項目20余項，其它級別的科研課題50余項，2007年科研經費到位800余萬元。在國內外學術期刊上公開發表學術論文100余篇，近20篇被SCI、EI和ISTP三大檢索收錄;獲省、部、局級獎項10余項。這些科研成果的獲得為煤及煤層氣地質與工程事業做出了積極貢獻，并極大地促進了學科的快速發展。
煤及煤層氣工程系的發展離不開學校、學院、兄弟院系以及各職能部門的大力支持，我們將以新的姿態創造新的奇跡，充分發揮在專業特色優勢，力爭建成國內一流的煤及煤層氣優秀人才培養和科學研究的基地，為我國的煤及煤層氣地質與工程事業做出新的貢獻。