廈門大學醫學院位于“海上花園”城市廈門，現任院長為教育部“長江學者”特聘教授劉祖國博士，黨委書記為邵鵬飛同志。1996年10月廈大醫學院的成立使廈門大學擁有了更完整的學科體系，醫學院秉承“自強不息，止于至善”的校訓，依托高水平綜合性、研究型大學的學科優勢，通過整合辦學資源，促進學科交叉，旨在培養醫學基礎雄厚、臨床技能扎實、人文素養深、創新能力強的“德高藝精、仁心仁術”型高水平醫學人才。
學院擁有廈門大學附屬中山醫院、廈門大學附屬廈門眼科中心、廈門大學附屬東南醫院、廈門大學附屬東方醫院、廈門大學附屬第一醫院、廈門大學附屬成功醫院、廈門大學附屬福州第二醫院等7家三級甲等醫院、20余家教學醫院與實習基地;同時還正在積極建設一所高水平綜合性的新附屬醫院——廈門大學附屬翔安醫院。
學院現有教職工560余人，碩博士生導師200余人，教授、副教授243人，其中雙聘院士4人，教育部“長江學者”特聘教授1人，國家杰出青年科學基金獲得者2人、福建省“閩江學者”3人。專任教師隊伍中具有博士學位的人員占76.1%，實驗技術隊伍中具有博士學位人員占11.67%。
學院下設基礎醫學部、臨床醫學系、中醫學系、眼視光系、護理系、福建省眼科與視覺科學重點實驗室、福建省神經退行性疾病及衰老研究重點實驗室、福建省慢性肝病研究重點實驗室、福建省抗癌研究中心、福建省基礎醫學實驗教學示范中心、福建省藥學實驗教學示范中心、海峽(廈門)中醫藥科技平臺、廈門市手性藥物重點實驗室、廈門大學眼科研究所、廈門大學消化疾病研究所、廈門大學器官移植研究所、中心實驗室和廈門大學醫學院——加州心臟核磁共振臨床教學與培訓基地等41個教學科研機構。其中國家級臨床重點�？�4個、省部級科技平臺6個、中國人民解放軍全軍�？浦行�9個、市校級科研平臺37個。
學院現有本科專業3個(臨床醫學、中醫學、護理學)、一級學科碩士點3個(臨床醫學、基礎醫學、中醫學)、博士點1個(生理學)和國家人事部博士后科研工作站3個，學院從2011年開始招收“本、碩、博一體化”拔尖創新人才班(大醫班)。目前在校生4000余人，其中碩、博士研究生500余人、本科生近1500人、留學生近200人、在籍海外函授生2200余人。
近年來，獲得國家“863計劃”、“973計劃”課題及省部級重大科研項目60余項;科研成果獲獎總數300余項，其中國家科技進步二等獎2項、省部級各類科研獎項109項、中華醫學二等獎1項，發表SCI收錄論文400余篇;2012年獲得國家自然科學基金51項(位列全校第1位)。
醫學院與多個國家和地區的高等院校和科研機構建立合作關系，聯合開展醫學前沿重大課題研究，并舉辦國內外以及海峽兩岸重要學術研討會議。同時與國外高等院校和機構簽署了一系列合作辦學和交換培養的協議和備忘錄，已有臨床醫學、護理學等專業多批次同學赴瑞典、新加坡等國家和香港、臺灣等地區交流學習。同時，還有來自世界各地的學生正在我院學習。
廈大醫學院肩負醫療衛生事業的社會責任和歷史使命，為50余個國家輸送了近萬名醫學人才。廈門大學占地面積3645畝的醫學及生命科學新校區的啟用，使醫學院跨越式發展的后發優勢更加強勁。廈大醫學院正站在新的起點，努力為廈大門學建設世界知名的高水平研究型大學打下更堅實的基礎，為中國及世界培養更多合格的高水平醫學人才!