廈門大學附屬中山醫院始建于1928年，由愛國華僑和地方知名人士為弘揚中山先生“天下為公，造福社會”的精神捐資興建而成，時任廈門大學校長、醫學專家林文慶博士出任首任院長，為福建省唯一985工程院校廈門大學的首家附屬醫院。歷經80余載中山人的拼搏進取，已發展成為一所集醫療、教學、科研、預防保健于一體的三級甲等綜合性醫院和國家重點大學研究型附屬醫院。
醫院2014年門、急診量280萬余人次，年收住病人近6萬人次，編制床位2500張;設有38個臨床學科、10個醫技科室、2個分院、2個分部、5個社區衛生服務中心;擁有國家臨床重點�？葡瘍瓤�、心內科;擁有廈門市臨床檢驗中心、廈門市消化疾病診治中心和廈門大學消化疾病研究所、廈門大學器官移植研究所、廈門市老年疾病康復研究所及廈門市腫瘤分子診斷與靶向治療重大科技平臺等重要醫學中心和科研平臺;為中華醫學會消化內鏡培訓基地、福建省超聲醫學培訓基地、全國健康管理示范基地;是福建省首批獲衛生部審核批準開展人體器官移植技術的醫院之一。醫院擁有多排螺旋CT、3.0T超導型MR、頭部伽馬刀以及PET-CT等先進醫療設備，設備總價值為7.3億。
醫院現有教職員工2600余名(其中高級專家470余名，碩士、博士以上學歷人員470余名，碩士生導師和博士生導師60余名)。醫院雄厚的技術力量和合理的人才梯隊推動醫院醫療教學科研工作闊步前進。醫院獲各級課題資助300余項，包括國家“863”和“973”子課題、國家自然科學基金、國家“十一五”科技支撐計劃等國家級課題40余項，獲部、省、市各級科技進步獎40余項，發表SCI論文100余篇，獲國家專利40余項，科研項目總量在全省名列前茅。在大量科研成果的有力支持，醫院每年開展大量臨床新技術、新項目，先后在本市率先開展肝臟移植、腎臟移植等高難度臨床手術，填補了大量技術空白，讓廣大廈門人民足不出戶就可以享受到優質、安全、高效的醫療服務。
醫院憑借地域優勢積極開展對外交流，特別是我院倡導建立的“海峽兩岸醫學論壇”和“中山醫學聯席會”，涵蓋消化、神經內外、超聲醫學、醫院管理等多個學科，分別已成為海峽兩岸醫學交流中最高水準的學術盛會和國內外知名度最高的“中山”系列醫學院所交流平臺。目前，“海峽兩岸醫學論壇”和“中山醫學聯席會”已突破以往會議討論和簡單交流的形式，通過相互培訓管理團隊、派遣一線醫務人員等方式逐步將各自的科研和教學工作緊密聯系起來。
近年來，醫院推進就醫流程改造，推行全天候、全預約、全自助、全網絡、全方位的“五全”惠民便醫服務，成立獨立隨訪室開展患者診后回訪，變被動服務為主動服務，將院內服務延伸至院外，極大地改善了患者的就醫感受;作為優質護理省級重點聯系醫院，醫院積極推進優質護理服務示范創建工作，努力落實整體護理，夯實基礎護理，建立“首見”負責制，實行“包床到護”，大大減少了患者自聘護工的數量,患者經濟負擔得到極大減輕,病房秩序更加安靜有序。通過上述舉措，醫院患者滿意度逐步提高，醫院2004年榮獲全國衛生系統先進集體，2010年獲全國衛生文化建設先進單位， 2011年獲全國“改革創新醫院”。
新時期，醫院將根據醫藥衛生體制改革的內在要求，繼續深入推進各項改革措施，探索分級診療試點工作，落實臨床路徑、抗菌藥物臨床合理應用專項整治等各項措施，加強醫務人員醫德教育，改善醫院醫療服務，強化醫院管理內涵和服務體系建設，深入推進醫療質量和醫療服務改進，努力為人民群眾提供更優質、更滿意的醫療服務。