醫院學科門類齊全，設有業務科室47個，臨床科室35個，輔診科室12個，臨床教研室20個，有博士授權學科28個，碩士授權學科33個，為臨床博士后流動站。醫院有10個國家重點學科，4個全軍醫學研究所，6個全軍醫學專科技術中心，2個上海市醫學領先專業重點學科，2個上海市臨床醫學中心，是全軍實驗診斷重點實驗室，國家藥品臨床研究基地，軍隊藥品臨床研究基地。
醫院技術力量雄厚，現有高級職稱專業技術人員244名，其中中國工程院院士1名，“長江學者特聘教授”各1名，“國家杰青”3名，在職三級以上教授11名，享受國務院頒發的政府特殊津貼人員47名，6人被總政治部和國家人事部批準為有突出貢獻的中青年專家。共40余人獲得國家“百千萬人才計劃”、上海市“百人計劃”、“曙光計劃”、“科技啟明星計劃”、“領軍人才”。10余人次評為上海市“十大科技精英”、“十大杰出青年”、“十佳醫師”、“十佳護師”。7人為總后勤部科技銀星、科技新星。11人榮獲上海市青年醫務人員最高榮譽獎“銀蛇獎”。擔任國際、國內學術組織重要職務505個。
醫院具有骨科、神經外科、腎內科、泌尿外科、整形外科、急救科等六大傳統優勢學科，形成了器官移植、微創治療、眼眶腫瘤治療、腫瘤早期診斷與治療、骨髓瘤及淋巴瘤診斷與治療、睡眠障礙治療、糖尿病及骨質疏松治療、真菌病的診斷與治療、外科傷病、頸動脈狹窄及大動脈瘤診治等九大新興醫療特色。疾病診治方面的成就和經驗獲得數十項醫療成果獎，其中軍隊、上海市重大醫療成果獎30余項�！笆晃濉币詠�，先后承擔國家、軍隊、地方大量科研攻關課題，三年獲得國家科技進步二等獎2項、國家教育部全國高等院校優秀研究成果科學技術進步二等獎1項、中華醫學科技一等獎1項、上海市科技進步一等獎3項、軍隊醫療成果一等獎2項、上海市醫學科技一等獎2項、省部級二等獎11項，還獲得了國家、軍隊、上海市教育研究成果獎5項;獲得省部級以上科研項目408項，資助金額1.42億元，其中國家自然科學基金158項;發表SCI收錄論文558篇，其中10分以上6篇，2010年發表SCI收錄論文193篇，全國醫療機構第13位，表現不俗論文排名第16位。
醫院擁有38層現代化病房大樓，樓頂有可起降直升機的停機坪。有醫療儀器設備6500多臺(件)，其中核磁共振成像儀(MRI)、數字減影血管造影機(DSA)、64排多排螺旋CT、核素掃描儀、彩色多普勒超聲儀、碎石機等大型醫療儀器100多臺，總價值5億多元。擁有國際先進的全凈化手術室、層流病房和重癥監護中心。醫院有先進的網絡信息系統和遠程會診中心，形成院前急救——院內急救——ICU病房的立體急救和戰時急救體系，具有24小時救治大批量傷員能力。
全院人員始終履行“姓軍為戰、姓軍為兵”歷史使命，牢記“救死扶傷、服務軍民”宗旨和“立德惟長、技卓以征”院訓，大力弘揚“艱苦奮斗、愛民奉獻、團結和諧、勇創一流”的“長征精神”。醫院先后被評為全國“雙擁模范單位”、“全國醫院文化建設先進單位”、上海市衛生系統“醫院文化建設十佳單位”;涌現出了“模范軍醫”呂士才、全國先進典型孔憲濤、腎內科血液透析中心、全國“三八紅旗手”、全國“優秀青年衛士”、全國衛生系統“巾幗建功標兵”、全軍“優秀共產黨員”、總后“學習成才標兵”、上海“十大杰出青年”、“新長征突擊手”等一批英模人物和先進集體。