物科學學院的前身是原中國人民解放軍軍需大學農副業生產系， 2004年8月原軍需大學移交教育部管理，與吉林大學合并后整合優勢學科組建而成。
學院涵蓋理學、農學和工學三大學科門類，具有生物學、作物學、植物保護學、農業資源利用學、園藝學5個一級學科，開設農學、植物保護、園藝、農業資源與環境、生物技術（植物）5個本科專業。
參與生物學博士后流動站和生物化學與分子生物學博士點的招生與建設，擁有植物學二級學科博士學位授權點，作物學、植物保護學、農業資源利用學3個一級學科碩士學位授權點，植物營養學、植物學2個二級學科碩士學位授權點，以及作物、植物保護和農業資源利用、園藝學3個農業推廣碩士學科點。其中作物遺傳育種學、植物病理學為省級重點學科。 2007年，植物保護專業被確立為國家 “ 第二類特色專業建設點 ” 。
學院擁有一支結構合理、素質良好、富有敬業精神的教職工隊伍，我院師資主要來自國內一流重點大學和研究機構，如中國科學院、中國農業科學院、浙江大學、哈爾濱工業大學、東北大學、中國農業大學、南京農業大學等。學院現有專職教師49人，返聘教師1人，實驗教師15人；其中教授10人，副教授14人，講師27人；高級職稱人員占教師總數的48.9% ，具有博士學位的教師占教師總數的71.4%；有博士研究生導師8人，碩士研究生導師34人；此外，又從中國農業科學院、香港中文大學、中國農業大學、南京農業大學、東北農業大學等科研院所聘任院士、長江學者獎勵特聘教授等7名專家為學院客座教授。學院現有在校本科生918人，研究生132人，在三屆畢業生中，40余人被推薦為北京理工大學、東北師范大學、南京農業大學、華南農業大學、吉林大學等知名院校免試研究生，占畢業生總數的16%；6名碩士研究生被國家留學基金委選派到德國、日本攻讀博士學位。
學院科研育人特色突出，設有植物生物技術實驗室、植物生理生化實驗室、生物學實驗室、植物遺傳育種實驗室、植物栽培與利用實驗室、植物保護實驗室、生態與氣候實驗室、農業化學和資源實驗室、農藥實驗室、CAD（計算機輔助設計）工作站、數碼互動顯微鏡實驗室、機械工程綜合實驗室共12個本科教學實驗室。為培養本科生科技創新能力，學院組建了植物基因工程研究中心、植物分子生物學研究室、生物種質資源與利用研究室、有害生物綜合防治研究室和農業生態與環境研究室等綜合研究平臺；正在建設以美國加州大學 林辰濤 教授為首席科學家的土壤 ―― 植物分子遺傳學實驗室。學院重視學生實踐能力培養，建有占地70萬平米的農業教學科研實習基地，其中示范用地53萬平米，實驗用地7萬平米，日光溫室3000平米，智能溫室2000平米，果園1.5萬平米。與10多家企事業單位合作建立了校外實習基地。
學院主持參加了國家“九•五”重中之重科技攻關、“ 十一•五 ”國家支撐、“973”、“863”項目、國家自然科學基金、行業發展計劃、留學歸國科研基金、省科技廳等項目科研課題，目前學院在研項目68項，到位經費1000 余萬元。先后獲得省部級科研成果19項，其中省級科技進步二等獎以上12項，三等獎6項。軍隊教學成果二等獎2項；主持國家多媒體教材、國家級電視教材、國家級網絡課程、吉林省精品課程各1門。建院幾年來公開發表論文520多篇，其中被SCI、EI收錄140余篇。學院積極開展國內、外交流與合作，在國內與十幾所高校與科研院所建立了科研合作關系，吸引了大批客座人員和訪問學者來院工作；在國外，先后與美國、加拿大、日本、澳大利亞、英國、德國、瑞典、菲律賓等10多個國家開展學術交流與合作，提供師生出國進修學習、攻讀學位、學術考察和合作研究等。
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