基礎學院建院于1997年，由上海理工大學與原南匯區人民政府聯合籌建，全部校舍由南匯區興建，是原南匯區第一所高等學校。這一區校合作模式在全國高校中率先走出了一條通過吸納社會資源實現超常規發展的新路。自1998年第一批本科學生入學至今，已辦學13年，培養了3萬余名大一學生。
基礎學院的主要工作內容是：學生管理、教學管理和后勤協調。學院針對地處南匯、遠離總校的特點，依靠總校和南匯區的大力支持，各專業學院的支撐，實現“育人、服務、管理”的辦學宗旨。
基礎學院的辦學理念是：“ 一個中心、兩個轉變、三個服務”。即以本科教學為中心：使新同學從高中生較快地轉變為適應大學素質教育的學生，使剛剛大學畢業的輔導員較快轉變為學生思想政治工作的主力軍；以育人為根本目標，通過服務學生、服務教師、服務教學，實現加強學生思想道德教育，穩定教學和生活秩序，努力提高教學質量。與此同時，逐步建設基礎學院，實現基礎學院持續發展。
基礎學院位于浦東新區（原南匯區）惠南鎮，占地總面積77300㎡（合116畝）、建筑面積27700㎡。
一、生活區
生活區有學生宿舍6個單元，共355間寢室，男240間，1698個床位，女115間，816個床位，可容納2500名學生；一座食堂，上下兩層、1000余個座位；室外400米標準跑道運動場1個，4個籃球場與三個排球場。
二、教學區
學院教學設施中有學術報告廳1個、多媒體教室34個、 一般教室14個，座位5286個；計算機房2個，教學用電子計算機375臺；圖書館分館藏書近5萬冊、訂閱雜志279種、報紙90種；1個1100㎡室內體育館，放置30只乒乓桌，羽毛球場地6個，并有有一可供文藝演出的舞臺。
三、學生和專業
基礎學院現有2011級新生2300余人。學生的教學與管理，采用跨校區多學科專業一年級大學生集中教學、管理與培養的模式。學生的學科大類有工學、經濟學、管理學、等3大學科，涉及機械設計及其自動化、金融學、會計學、市場營銷、電子商務、工程管理、國貿經濟、電氣工程及其自動化、自動化、電子信息科技、動力類專業、環境工程、建筑環境、交通工程、土木工程、等幾十個專業類別，分屬于上海理工大學下屬的動能工程學院、管理學院、光計學院、機械工程學院、環境學院等5個二級學院。學生在基礎學院學習的一個學年，需完成大部分基礎課程和部分專業基礎課的學習任務，第二學年轉入各專業學院繼續進行專業基礎課和專業課的學習。
四、學院管理隊伍
基礎學院現有在編教職工18人，其中院黨政領導干部3人、行政管理人員4人、政治輔導員12人。學院下設綜合辦公室、教學辦公室和輔導員工作室，分別負責學院的行政、教學管理和學生管理工作。
輔導員隊伍建設培養
結合基礎學院跨校區辦學模式和新時期輔導員隊伍綜合素質提高的特點，將學生思政工作、行政工作、教學與教學管理“四結合”（學生思政工作、行政工作、教育管理工作。教學科研教工作），努力建設培養一支素質高、有活力、肯吃苦、能戰斗的思想政治輔導員隊伍。
學生和學生干部隊伍建設培養
以學生黨建工作為抓手，積極開展大學生思想教育工作。開門辦黨校，開展眾多的社團活動，使大學生真正成為校園文化建設主力軍。利用校區周邊地區的社會資源，積極組織大學生開展社會實踐活動，已有文明共建單位鎮人大、電信局、文化館、圖書館、看守所、派出所、交警局、校辦二廠等八家單位�；A學院辦學多年來已形成了傳承百年老校的優良傳統的新基礎學院精神：“勇于吃苦 團結協作 開拓創新 奮發有為”。學院連續三年獲得學校精神文明“雙十佳”獎勵，其中連續四年獲得校精神文明“十佳好人好事”榮譽。2009年更是獲得“2007－2008年度校級文明標兵單位”稱號殊榮�；A學院大一學生在學校體育文化建設中也是久負盛名、屢創佳績的勁旅，全校合唱比賽一等獎，連續兩年冬季長跑冠軍�；A學院全體員工決心在校黨委的領導下，以科學發展觀為指導有決心，有信心，把學生培養教育工作做得更好，力爭把學院辦成一所校領導放心，學生高興，家長稱心，教工順心的優秀學院。