北京大學前沿交叉學科研究院(Academy for Advanced Interdisciplinary Studies，Peking University)是北京大學跨學科的研究平臺。2005年12月28日，學校發文成立前沿交叉學科研究院(校發[2005]288號)，全國人大常委會副委員長、中國科協主席、北京大學醫學部主任韓啟德院士擔任院長，方競教授擔任常務副院長。2006年4月4日，前沿交叉學科研究院成立大會在北京大學隆重舉行。時任北京大學校長的許智宏院士在研究院成立大會上的講話中指出：“前沿交叉學科研究院的成立將是北京大學歷史上十分重要的一筆，對北京大學的學科建設、科學研究發展和綜合素質人才的培養等都具有十分重要的意義。”韓啟德院長對研究院的發展提出了24個字的方針：虛實結合，摒棄浮躁，完善制度，項目帶動，兼容并包，外向開放。
當代科學的發展和重大科學技術成就的取得，越來越依賴于不同學科之間的交叉與融合，許多有影響的科技成果，都是在學科的交叉點上取得的。近些年來，國內外許多政府機構和著名大學紛紛組織建立跨學科研究機構，支持交叉學科發展，并逐步取得各種重要成果。北京大學具有很好的基礎學科和技術學科優勢，學科齊全、基礎雄厚是北京大學的重要特點。北京大學的多學科特點為發展跨學科研究提供了獨特的優勢和重要的基礎條件。在“創世界一流大學計劃(一期)”的支持下，北京大學已經建立了若干跨學科研究中心，為建設整體的跨學科研究平臺打下了良好基礎。前沿交叉學科研究院的成立，是建設整體性的跨學科研究平臺的重要一步。
前沿交叉學科研究院的基本任務是組織跨學科的學術交流、開展跨學科的科學研究和培養交叉學科的優秀人才。研究院將以北京大學雄厚的基礎學科和先進的技術學科為基礎，組織聯合相關的研究力量，建設具有良好學術交流環境、學科前沿性與學科交叉性相結合、實體與虛體相結合的交叉學科研究平臺，為北京大學的交叉學科研究創造良好的學術氛圍和研究條件;研究院將開展前沿性的問題研究和科學技術攻關，使北京大學在一些重要領域進入國際前列;研究院將在研究生主管部門的指導下，與相關院系和學科合作，努力探索交叉學科人才培養模式，使之成為高層次綜合人才培養的重要基地;研究院的管理體制將以有利于促進學科交叉和創造良好學術氛圍為基本準則，采用虛實結合、研究人員專聘與兼聘相結合等多種靈活方式，資源在校內外共享。
前沿交叉學科研究院成立以來，通過探索科研與管理機制創新、推動基礎條件建設、招聘和引進優秀科研人才、組織學術交流與研究項目申請等工作，有力地促進了研究院的體制建設、學科建設和隊伍建設。在前沿交叉學科研究院的框架下，各個研究中心以各自已有的條件為基礎，面向科學技術發展和國家社會需求，組織多學科的研究力量開展前沿性問題的研究和科學技術攻關，獲得了各類跨學科研究項目的支持，并已經取得了若干重要的研究成果。