植物病理學科1982年開始招收碩士研究生，1986 年獲得碩士學位授予權，1988年被評為省人事廳重點學科和重點學科帶頭人梯隊，2001年被評為省教育廳重點學科。為省植物病理學會掛靠單位。是國家計委立項的“211工程”重點建設學科之一。學科實驗室總面積1000多平方米，儀器設備總值1300余萬元，達到國內先進水平。學科實驗室隸屬于農業部 “寒地作物生理生態重點開放實驗室”和教育部“大豆生物學重點實驗室”，以本學科為依托的植保實驗中心為國家和省級實驗教學示范中心，設有中央與地方共建 “有害生物防治”基礎實驗室。植物保護專業2004年被列為校級重點專業，2007年被列為黑龍江省重點專業。
近年來獲得國家“211工程”建設資金、農業部和教育部重點實驗室專項資金、中央與地方共建基礎實驗室專項資金、國家和省級實驗教學示范中心專項資金、校級和省級重點專業建設專項資金、省級重點學科專項資金和學校重點課程建設資金共計1856萬元。目前學科共10人，其中教授3人，副教授3人，講師級2人，助教1人。博士6人，碩士3人，學士1人。5人具有校外學歷，其中2人具有國外學歷。博士生導師2人，碩士生導師6人。此外還聘請留美植病學家李永鎬教授為講座教授。
本學科具有3個穩定明確的研究方向：植物病原生物學、寄主與病原物的相互作用、植物病害可持續控制的關鍵技術。近年來承擔國家級項目11項，省部級項目17項，廳局級項目23項，總經費約839.3萬元。獲省科技進步二等獎1項，市科技進步二等獎 1項，省農業科技進步一等獎1項。獲國家發明專利3項，實用新型專利3項。發表科研論文72篇(SCI收錄3篇)。主持省級教學項目2項，校級教學項目2 項。出版專著(教材)9部，其中國家級出版社7部(主編1，副主編1，參編5)，省級出版社2部(副主編1，參編1)，主編校級教材9部。發表教學論文 10篇。建成兩門校級精品課程。主編的國家級教材獲校優秀教材二等獎;《植物保護學》課件獲學校第三屆多媒體課件評比二等獎。
近三年共招收博士研究生4名，授予學位3名;招收碩士研究生27名，授予學位27名，授予推廣碩士學位9名。