馬克思主義學院成立于2010年12月，其前身——馬列教研室成立于1951年，由延安抗大教員、曾任東北農學院黨委副書記和黑龍江大學黨委書記的鄒寶鑲同志創建，是當時東北地區最早建立的三個馬列教研室之一。 通過創辦政治教育研究班、師資班和馬列主義業余大學，做了大量開創性的工作，贏得了很高的聲譽。2008年獲得馬克思主義理論一級學科碩士學位授權點。
在60年的發展歷程中，我校馬克思主義理論教學科研機構設置從馬列教研室到社會科學部，再到人文社會科學學院社會科學系，幾經變化和整合。2009年,學校黨委積極落實中央《關于進一步加強和改進高等學校思想政治理論課教師隊伍建設的意見》，成立了思想政治理論課教學科研部，為學校直屬的二級教學科研機構。2010年,學校又整合校內相關學科和教師資源，成立了馬克思主義學院。馬克思主義學院的成立,標志著我校思想政治理論課教育教學、馬克思主義理論研究和學科建設，有了新平臺，進入了新的發展階段。
在學校黨委的正確領導下，在幾代馬克思主義理論工作者的不懈努力下，我校思想政治理論課教育教學和馬克思主義理論學科建設取得了優異成績和豐碩成果。在1996年和2000年全省“兩課”評估中，我校“兩課”教育教學均被評為優秀;2006年獲得馬克思主義基本原理與思想政治教育二級學科碩士學位授權點，2010年獲得馬克思主義理論一級學科碩士學位授權點。
學院目前設有四個教研部：馬克思主義基本原理教研部、中國近現代史綱要教研部、思想道德修養和法律基礎教研部、毛澤東思想和中國特色社會主義理論體系概論教研部。學院承擔全校本科生、碩士研究生和博士研究生的思想政治理論課教學工作。學院目前面向全國招收“馬克思主義基本原理”和“思想政治教育”專業碩士研究生。現有在校碩士研究生96名。
學院現有專任教師18人，是一支思想政治素質優秀、學歷層次較高、職稱結構合理、教學科研水平較高、發展潛力較大的隊伍。其中，博士9名，在讀博士1名，碩士8名;教授5人，副教授8人;博士生導師2人、碩士生導師11人;1人獲得中共黑龍江省委宣傳部“黑龍江省宣傳文化系統‘六個一批’理論人才”稱號，1人被評為黑龍江省優秀教師和黑龍江省思想政治理論課優秀教師，十余人擔任省級各類學會常務理事。
學院將堅持正確的政治方向，以提高教學質量為核心，以學科建設為突破口，以服務于高質量人才培養為目的;將堅持科學發展的理念，以人為本，以德為先，以務實為基，以創新為魂，以質量求生存，以特色求發展。學院崇尚和諧、提倡敬業、追求務實，鼓勵進步、尊重奉獻，將努力形成一流的合作團隊、營造一流的學術氛圍、打造一流的師資隊伍、創建一流的學科專業、實現一流的育人質量，不斷開創新局面，不斷取得新成果，不斷獲得新發展。