經濟學系前身為1918年暨南大學開設的商科。20世紀三、四十年代，著名經濟學家馬寅初先生與《資本論》的譯者王亞南先生先后在經濟學系執教，為經濟學系的教學與研究鋪墊了深厚的底蘊。
1958年，暨南大學在廣州重建時恢復設立經濟學系，成為華南地區最早設立的經濟類系科。復辦以來，經濟學系集中了各地優異人才，培養了數千名畢業生，任職于港澳臺、海外及內地工業、商貿、房地產、金融企業、政府部門、經濟管理等部門。許多已成為單位的業務骨干，并在各行各業擔任重要領導職務，為國家的經濟建設做出了重要貢獻。
1980年，政治經濟學專業就獲得了中國第一批碩士學位授予權資格，為我校經濟類學科的發展壯大奠定了堅實基礎。經濟學系曾擁有的會計學、國際經濟、工業經濟、貿易經濟等教研室，其后都分別發展成為了經濟學院和管理學院現在相應的專業和系所。