水利水電學院是河海大學的骨干學院。學院的前身是1952年建立的水力發電系、水工結構系和水利土壤改良系，1954年，水力發電系和水工結構系合并為河川系，1958年，水利土壤改良系改名為農田水利工程系，1985年，河川系改名水力發電工程系。1995年，學校機構調整，以水力發電工程系、農田水利工程系、水利水電科學研究所等系所為基礎組建成立了水利水電工程學院，學院設有水利水電工程系和農業水利工程系。2009年，根據學科發展趨勢學院更名為水利水電學院。
學院現有教職工134人，其中專任教師103人。專任教師中有中國工程院院士1人，長江學者特聘教授3人，河海學者特聘教授2人，博士生導師24人，教授35人，副教授33人。同時，學院還聘請雙聘院士3人，兼職博導6人，兼職教授33人。目前，學院有本科生 1400余人、碩士生700余人、博士生200余人、工程碩士300余人。
學院有“杰出青年基金獲得者”2人、“新世紀百千萬人才工程”國家級人才2人、江蘇省“333高層次人才培養工程”科技領軍人才 2人、中青年科學技術帶頭人6人、江蘇省“青藍工程”學術帶頭人2人、青年骨干教師3人。各學科已形成了以具有博士學位的中青年教師為主體的學科梯隊，并與國外10多所著名大學聯合培養博士研究生，積極推進研究生培養模式的國際化。
學院學科覆蓋面廣。學院現有博士點學科6個、碩士點學科8個和本科專業3個。博士點學科包括水工結構工程、水力學及河流動力學、水利水電工程、水災害與水安全、水利水電建設工程管理和農業水土工程等，其中，水工結構工程、水力學及河流動力學和水利水電工程均為水利工程國家重點學科中的二級學科;碩士點學科除了上述6個博士點學科以外，還有農業生物環境與能源工程和土壤學等學科;本科專業有水利水電工程、農業水利工程、設施農業科學與工程等，分屬水利水電工程系和農業水利工程系。同時，學院還設有水利工程博士后流動站，教育部水利水電工程安全工程研究中心、南方地區高效灌排與農業水土環境教育部重點實驗室以及南京市土工合成材料工程技術研究中心均掛靠我院。本學院也是水文水資源與水利工程國家重點實驗室和水資源高效利用與工程安全國家工程研究中心的主要建設學院。
50多年來，水利水電學院為國家培養了1萬多名畢業生和許多著名的專家、教授，其中有中國科學院、中國工程院院士7人，還有 10多人擔任了省、部級領導干部，更多的人已成為生產、科研和教學第一線的業務骨干，他們在自己的工作崗位上為我國水利水電建設和管理事業做出了重大的貢獻。經過數十年的建設與發展，學院的水利水電工程專業和農業水利工程專業已成為國內頗具影響的品牌專業。學院國際合作交流成效顯著，并為亞、非地區的發展中國家培養了大批的留學生。同時，長期聘用外籍老師，經常舉辦國際和國內學術會議。
近年來，學院發揮綜合優勢，先后承接了三峽、向家壩、龍灘、二灘、錦屏、拉西瓦、溪洛渡、白鶴灘、小灣、小浪底、水布埡、雙江口、兩河口、南水北調等遍及全國各地的重大水利水電工程的科研項目，研究經費超過1億元，取得了大量成果，發表論文2000余篇，出版教材、專著80余部。先后獲得國家科技進步特等獎、二等獎、三等獎和省部級科技進步獎等80余項。