金屬硫蛋白基因的分子進化分析論文提綱
論文摘要: 金屬硫蛋白(metallothionein,MT)是一種具有重要生物學功能的蛋白質.迄今為止,發現并確定了氨基酸(略)蛋白超過200種.金屬硫蛋白一般由61~68個氨基酸組成,含有保守的20個半胱氨酸殘(略)地結合銅鋅等重金屬,具有維持微量元素的代謝平衡、重金屬解毒、影響細胞的增殖與凋亡、清除自由基及參與應激反應等重要的生物學功能. 金屬硫蛋白的編碼序列及氨基酸序列包含了大量的生物信息.傳統(略)中于金屬硫蛋白的結構和功能,而忽略了對其結構和功能起決定作用的基因序列、代謝途徑和調控網絡等的研究.這些序列中含有大量的生物信息,從中挖掘出重要的生物知識,有利于為金屬硫蛋白的深入研究提供參考和指導. 本研究從金屬硫蛋白的數據庫中搜集其編碼序列及氨基酸序列,利用貝葉斯方法構建其系統發育樹.同時根據系統發育樹(略)白基因劃分為五個亞家族,對每個亞家族進行氨基酸使用頻率統計以及選(略)指出了在進化中較保守的對其功能有重要作用的氨基酸位點以及各亞家族在進化過程中受到的選擇作用. 本研究同時搜集了哺乳動物的金屬硫蛋白基因及氨基酸序列,利用鄰接法構建了哺乳動物金屬...
Meta(omitted)n is a protein with(omitted) biologic(omitted)ns, called MT for abbreviation. So far, the amino acid sequences of metallothionein discovered and identified are more than 200. Metallothioneins are g(omitted)omposed of 61-68 amino acids in length, contain 20 conserved cysteine residues, and can be effectively combined with zinc and other heavy metals, with i(omitted)iological functions, including maintaining metabolic balance, heavy metal detoxification, cell proliferation and apoptosi...
目錄:中文摘要 第8-9頁
英文摘要 第9-10頁
1 引言 第11-27頁
·金屬硫蛋白的研究 第11-18頁
·金屬硫蛋白的結構與分類 第11-13頁
·金屬硫蛋白的基因結構及調控 第13-15頁
·金屬硫蛋白的功能 第15-17頁
·金屬硫蛋白的應用 第17-18頁
·分子進化分析研究 第18-26頁
·生物信息學的發展 第18-19頁
·系統發育分析 第19-23頁
·蛋白質的中性與適應性進化 第23頁
·基于系統發育樹的似然法檢驗自然選擇作用 第23-25頁
·利用功能分歧系數檢驗自然選擇作用 第25-26頁
·研究的目的與意義 第26-27頁
2 材料與方法 第27-29頁
·實驗一序列 第27頁
·實驗一方法 第27-28頁
·序列比對與系統發育樹構建 第27頁
·選擇壓力分析 第27-28頁
·實驗二序列 第28頁
·實驗二方法 第28-29頁
·序列比對與系統發育樹構建 第28頁
·選擇壓力分析 第28頁
·功能分歧分析 第28-29頁
3 結果與分析 第29-42頁
·實驗一分析結果 第29-36頁
·實驗序列選取 第29頁
·系統發育樹構建 第29-32頁
·選擇壓力分析 第32-36頁
·實驗二分析結果 第36-42頁
·實驗序列選取 第36頁
·系統發育樹構建 第36-39頁
·選擇壓力分析 第39-40頁
·功能分歧分析 第40-42頁
4 討論 第42-44頁
·實驗一系統發育樹構建 第42頁
·實驗一選擇壓力分析 第42頁
·實驗二系統發育樹構建 第42-43頁
·實驗二選擇壓力分析與功能分歧分析 第43-44頁
5 結論 第44-45頁
致謝 第45-46頁
參考文獻 第46-51頁
附錄 第51-55頁
攻讀碩士學位期間發表的學術論文 第55頁
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