養(yǎng)殖水體中細(xì)菌遺傳多樣性研究提綱
論文摘要: 近年來隨著分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,從分子水平對微生物的群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究己經(jīng)成為可能.PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))、RFLP(限制性片段長度(略)的建立和DNA測序(略)善以及這些技術(shù)的融合產(chǎn)(略)、快速、有效的微生物群落結(jié)構(gòu)分析方法,即T-RFLP(末端標(biāo)記限制性片段長度多態(tài)性).該方法有傳統(tǒng)方法無可比擬的優(yōu)越性,它建立在PCR的基礎(chǔ),不需要分離培養(yǎng)細(xì)菌,因而避免了培養(yǎng)方法的弊端.更重要的是該方法可以檢測到環(huán)境中所有的菌,包括活菌(可培養(yǎng)的和不可培養(yǎng)的)和未降解的死菌.本文利用T-RFLP(末端標(biāo)記限制性片段長度多態(tài)性)技術(shù)對蝦塘養(yǎng)殖水體中的細(xì)菌進(jìn)行分類,同時檢測投加硝化細(xì)菌前后水體中細(xì)菌的種群變化情況,探索細(xì)菌種群變化情況對魚蝦養(yǎng)殖的影響規(guī)律. 本研究對硝化細(xì)菌富集培養(yǎng)系統(tǒng)中微生物多樣性進(jìn)行了研究,(略)集培養(yǎng)的硝化細(xì)菌在0-12h為延遲期;12h左右進(jìn)入對數(shù)生長期;60h左右開始穩(wěn)定期,菌量達(dá)到6.03×10~9個;120h以后開始衰亡期(略)到穩(wěn)定期120h時,硝化細(xì)菌的多樣性指數(shù)相比最高下降了67%,均勻度指數(shù)上升了10.3%,硝化細(xì)菌豐度比例達(dá)到97%....
In recent years, with the rapid development of mole(omitted)ogy techniques, it hasbecome pos(omitted)tudy the microbial (omitted)structure from the molecular level.Currently, a kind of analysis of microbial community structure that was new, fast and effectivewas created, called T-RFLP (Terminal Restriction fragment length of Poly(omitted) becausethe technologies that were PCR (Polymerase Chain Reaction) and RFLP(Restriction Fragmentlength Polymorphism) were established, DNA sequen(omitted)ologies...
目錄:摘要 第6-7頁
Abstract 第7-8頁
第1章 緒論 第11-27頁
·養(yǎng)殖水體微生物多樣性的研究概況 第11頁
·研究背景 第11頁
·微生物多樣性對養(yǎng)殖水體的影響 第11頁
·微生物多樣性的研究方法 第11-25頁
·傳統(tǒng)方法分析細(xì)菌群落多樣性 第12頁
·微生物分子生態(tài)學(xué)研究方法 第12-25頁
·本文研究目的、意義及主要內(nèi)容 第25-27頁
·研究目的及意義 第25頁
·主要研究內(nèi)容 第25-27頁
第2章 硝化細(xì)菌投加菌的多樣性研究 第27-40頁
·材料與方法 第27-28頁
·材料 第27-28頁
·實(shí)驗(yàn)方法 第28-32頁
·硝化細(xì)菌的富集培養(yǎng) 第28頁
·熒光原位雜交法檢測硝化細(xì)菌生長曲線 第28-31頁
·T_RFLP 技術(shù)對富集硝化細(xì)菌的多樣性研究 第31-32頁
·結(jié)果 第32-39頁
·硝化細(xì)菌生長曲線的FISH 方法檢測 第32-36頁
·T_RFLP 對硝化細(xì)菌多樣性的研究 第36-39頁
·結(jié)論 第39-40頁
第3章 養(yǎng)殖水體中細(xì)菌多樣性影響對蝦產(chǎn)量的研究 第40-50頁
·材料 第40頁
·取樣 第40頁
·實(shí)驗(yàn)方法 第40-41頁
·蝦塘水DNA 提取 第40頁
·提取DNA 的檢驗(yàn) 第40-41頁
·PCR 擴(kuò)增 第41頁
·DNA 純化 第41頁
·酶切及電泳分析 第41頁
·測序儀分析 第41頁
·結(jié)果 第41-48頁
·水塘水樣總DNA 的獲得 第41-42頁
·PCR 擴(kuò)增結(jié)果 第42-43頁
·酶切電泳結(jié)果 第43-44頁
·T_RFLP 圖譜 第44-46頁
·數(shù)據(jù)處理 第46-48頁
·討論 第48頁
·DNA 的提取 第48頁
·PCR 反應(yīng)條件 第48頁
·結(jié)論 第48-50頁
第4章 養(yǎng)殖水體中可培養(yǎng)細(xì)菌分類研究 第50-59頁
·材料方法 第50-51頁
·樣品采集及處理 第50頁
·材料 第50頁
·方法 第50頁
·DNA 提取 第50-51頁
·提取DNA 檢驗(yàn) 第51頁
·PCR 擴(kuò)增 第51頁
·DNA 純化 第51頁
·酶切及電泳分析 第51頁
·測序儀分析 第51頁
·結(jié)果 第51-57頁
·提取菌株的DNA 結(jié)果 第51-52頁
·PCR 擴(kuò)增結(jié)果 第52-53頁
·酶切電泳結(jié)果 第53頁
·T_RFLP 圖譜 第53-57頁
·討論 第57-58頁
·T_RFLP 進(jìn)行菌株分類的軟件分析 第57頁
·T_RFLP 的測序優(yōu)缺點(diǎn) 第57-58頁
·結(jié)論 第58-59頁
結(jié)論和展望 第59-61頁
參考文獻(xiàn) 第61-69頁
攻讀碩士學(xué)位期間取得的研究成果 第69-70頁
致謝 第70頁
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