臺灣高校申請和大部分國外院校申請方式一樣，采用人性化的網絡報名形式。申請人在規定時間內登錄“大學校院招收大陸地區學生聯合招生委員會”的官方網站，點擊“線上報名”，按照規定上傳電子版證件照、身份證、財力證明、藝術生類別證明材料，并繳納500元人民幣左右的報名費后即可完成所有報名程序，每位申請人至多可選填 36個校系志愿(學校+專業)，但每校至多可選填 5個志愿(專業)。
此外，臺灣高校也必須按文理科分類進行志愿選填，如申請人高考屬文科，則僅能選填招收文科或文理兼收之志愿，反之亦然。
提醒：若申請人想要以藝術生身份申請來臺就讀，請一定要保留省統考或市統考的準考證及合格證，若無法提出，則將會以普通生分數線進行審查。
對于臺灣留學的前景，臺灣大學副校長湯明哲曾說過，“知識和人才沒有界限，沒有‘國界’。在兩岸教育交流上，尤其是臺灣，要多給予引導，少設限制。”臺灣作為大陸學生新興目的地，通過兩岸學生的這種常來常往，對兩岸學生交流、學術交流起到促進驅動器一樣的推動作用。