東南大學圖書館是我國歷史最悠久的大學圖書館之一，其前身是始建于1902 年的三江師范學堂藏書樓。1923年國立東南大學時期，獨立建館，定名為國立東南大學孟芳圖書館，該建筑被稱為中國20世紀初期圖書館建筑的優秀作品之一。一百多年來，圖書館先后經歷南京高等師范學校“圖書儀器部”、國立東南大學孟芳圖書館、國立中央大學圖書館、南京工學院圖書館等歷史發展階段， 1988年，復更名為東南大學圖書館。2000年4月南京鐵道醫學院等院校與東大合并，2007年3月九龍湖新校區圖書館建成。目前，東南大學圖書館形成了九龍湖校區總館、四牌樓校區工學分館、丁家橋校區醫學分館的圖書館體系，整體布局合理，功能齊全，圖書館的服務功能得到了進一步提高。
圖書館現有館舍面積66900平方米，總閱覽座位5500多席，累計館藏紙質文獻392.53萬冊，中、外文現刊5800多種;中外文數據庫104種，含電子圖書170.81萬冊，電子期刊4.1萬種。館藏文獻以理工科、生物醫學為主，兼及人文社科、管理學科等，形成了電子信息、土木建筑、生物醫學等學科的館藏特色。各個校區分館實行統一的開放制度，每周開館時間達98小時，主要閱覽室從早上8時連續開放至晚間10時，年入館讀者約280萬人次。圖書館公共閱覽區為讀者提供網絡連接端口和用于查詢的計算機終端，總館公共區域可通過無線方式接入網絡，讀者可以方便地查詢館藏信息、使用各類專業數據庫等。圖書館每天24小時不間斷地提供網絡信息服務，學校師生可以通過校園網上任意客戶端自由訪問各種數據庫資源或自行預約和續借圖書。
圖書館設有辦公室、流通服務部、信息服務部、采編部、系統與數字化建設部、文獻情報教研室、科技查新工作站、四牌樓工學分館和丁家橋醫學分館等九個部門�，F有在職職工131人，其中正高職稱4人，副高職稱13人，中級職稱68人，具有博士學位者6人，碩士(含雙學位)49人。全體館員本著“讀者至上、服務第一”的宗旨，努力為讀者營造文明、有序、舒適、開放的學習和信息利用環境，為東南大學的教學和科學研究提供強有力的文獻信息服務保障。
教育部在東南大學圖書館設有“教育部科技查新工作站”和“教育部外國教材中心”，科技查新工作站面向校內外用戶提供科技成果鑒定、評獎及科技項目的查新服務，外國教材中心以土木建筑和力學等學科的外國教材收藏為主。作為CALIS(中國高等教育文獻保障系統)成員館和JALIS(江蘇省高等教育文獻保障系統)成員館，東南大學圖書館還擔負館際合作共建的重任。JALIS在東南大學圖書館設有“江蘇省高校工學文獻中心”和“江蘇省高校西文圖書采編中心”，工學文獻中心承擔工程技術文獻資源的建設，高校西文圖書采編中心承擔為江蘇高校采集外文圖書資源的任務。設于館內的東南大學情報科學技術研究所，擔負著圖書館學碩士點教學和各類型資源培訓的工作。
東南大學圖書館正朝著建設“與東南大學地位相適應的，富集人文，促進學習，支撐科研和學科發展的大學圖書館，成為學校的文獻信息中心、知識共享中心和文化活動中心”的目標不斷開拓,努力向前!