根據國務院學位辦和教育部的規劃要求，未來幾年，專碩招生規模還將繼續擴大。有業內人士對此表示擔憂，認為如果繼續依賴過去傳統學術碩士的師資和培養方式，不從根本上改變高校畢業生與社會需求脫節的問題，那么擴招后的專碩培養質量和就業前景就不容樂觀。
“專業學位研究生教育在培養目標、課程設置、教學理念、培養模式、質量標準和師資隊伍建設等方面，與學術型研究生有所不同，要突出專業學位研究生教育的特色。”這是教育部《關于做好全日制碩士專業學位研究生培養工作的若干意見》中對專業碩士培養提出的要求。與學術型研究生以學術研究為導向、著重培養教學科研人才不同，專業學位研究生定位于面向產業需求，以培養高層次應用型人才為主，更注重職業技能的掌握。
我國的專碩人才培養起步較晚。在2009年擴招以前，專碩主要面向在職人員招錄，而且只有學位沒有學歷，以致于在很長一段時間里，無論是考生還是用人單位，對專碩都不太感興趣。
事實上，一些高校開設的專業碩士課程和學術碩士的課程沒有本質區別。2010年被調劑到廈門某高�？刂乒こ虒I的小吳同學告訴記者，入學一年多來，發現“工程專業碩士和工學碩士在培養方案和課程設置上幾乎一樣”。而該校新聞傳播學院的教師也證實，首屆專業碩士的培養方式和學術碩士同步，院方稱是“為了方便教學管理”。
教育部要求專業碩士培養要實行“雙導師”制，這對高校和企業都是挑戰。據福建師大研究生處的一位教師介紹，目前高校聘請的企業兼職教師精力有限，而且既有實踐經驗，又有相當理論水準的兼職導師很少，學校派教師去企業鍛煉積累經驗需要一個比較長的過程。
“社會需要科學家、理論家，也需要大量工程技術和服務產業一線的技能型人才，高校同質化帶來的問題應該引起高度重視。”廈門大學教育研究院名譽院長潘懋元教授認為，高等職業教育評價體系如果參照精英教育、研究型大學的標準來設定，招生渠道、培養模式、管理方式不變，那么對高層次應用型人才（如專碩）的培養方向肯定會“走偏”。
“專業碩士研究生除了達到研究生培養的基本要求，更重要的是凸顯其‘專業化’要求，只有根據不同的職業背景和行業需求來進行專業教育才能達到專業化要求。”沈陽師范大學研究生處趙研教授強調，培養具有實踐性操作技能的專業人才是專業學位教育發展的未來趨勢。
“伴隨學歷提升，學科門類、專業方向不斷細化、深化，如果研究方向設置不合理將直接導致培養出來的學生就業路子變窄。”廈門理工學院校長黃紅武教授認為，學校不能只根據現有師資力量和導師研究方向來設置專碩培養方向，要根據職業需要來設置培養方向和聘任老師，課程教案也要根據行業最新變化和產業需求來及時調整，“發展專業學位碩士必須著眼于國情、校情，結合地方經濟社會發展現狀以及趨勢，所培養的人才最好能對接地方產業發展需求”。
為了體現專業碩士和學術碩士培養的差異，廈門理工學院嘗試讓專業碩士一進校門就具有在校生和企業員工的“雙重身份”。
按照廈門理工學院的要求，全日制專業碩士學制中至少要在企事業單位呆一年，并實行彈性學制；課程設置與職業資格認證相銜接；考核形式主要看學生在讀期間參與產品研發、工程設計、調研報告、工程項目管理等情況。
據悉，今年廈門理工學院首屆錄取的50名準研究生當中，已有半數以上拿到了當地27家知名企業提供的“預就業”崗位。