東北農業大學研究生教育始于20世紀50年代。我校是國務院首批具有博士、碩士、學士三級學位授予權和博士、碩士導師及教授、副教授資格審定權的高等院校之一。研究生教育一直作為我校的強校之路，經過半個多世紀的發展，已經擁有7個博士后科研流動站、1個博士后科研工作站、6個一級學科博士點， 31個博士學位授權點，1個專業博士點，7個一級學科碩士點，61個碩士學位授權點，4個專業碩士點。博士生導師161人，碩士生導師463人。
經過幾代東農人的建設，我�，F有學科規模不斷擴大，多學科學位點體系基本形成。擁有3個國家級重點學科，3個國家重點(培育)學科，2個部級重點學科，2個省級重點學科群，6個省級一級重點學科，29個省級二級重點學科(包括涵蓋學科)，黑龍江省人事廳重點學科帶頭人梯隊18個，30個校級重點學科。已經形成了國家級、省級、校級三級重點學科建設層次，為學科建設和研究生教育發展提供了必要的支撐與保障。
通過“211工程”重點建設，我校擁有先進的儀器設備和較好的實驗條件，為高素質人才培養奠定了堅實的基礎。我校研究生教育始終堅持既注重培養理論型、研究型人才，又注重培養應用型、技能型人才的理念，尤其注重培養學生的創新意識、創新精神和創新能力，先后培養出“全國首屆百篇優秀博士論文”獲得者蔣恩臣、主持億元大項目的首鋼總工程師董承茂、世界首例“克隆猴”研究的主要參與者孟勵。“全國跨世紀獎學金”獲得者李星海、獲得世界轉基因大獎的年輕科學家周琪等一大批優秀的博士、碩士研究生。
招生規模逐漸擴大，2007年我校招收碩士生875名、博士生136名。目前，統招研究生在校生人數達到2969人，其中碩士2510人，博士459人。在站博士后研究人員116人。同時，我們積極申請專業碩士學位，擁有農業推廣碩士、獸醫碩士、工程碩士、高等學校教師在職攻讀碩士的資格，以及獸醫博士專業學位授予資格。在讀工程碩士98人，農業推廣碩士482人，獸醫碩士81人，高師碩士105人，獸醫博士10人。
為了提高培養質量，鍛煉研究生的實踐動手能力和科研創新能力，我校先后和中科院、哈獸研、黑龍江省農科院、哈爾濱工業大學等科研所和著名大學建立了密切的聯系，聘請了多名外單位導師，聯合培養碩士生、博士生。同時，我們加強了對博士后的聯合培養，先后與黑龍江省農科院、完達山乳業集團、北大荒農墾集團公司、黑龍江省科學院、國家大豆研究中心、黑龍江大學甜菜研究所、哈爾濱商業大學藥物研究所、伊春林管局等知名企事業建立合作關系，聯合招收博士后研究人員。
學校研究生教育管理人員素質較好，力量較強。經過新老同志的共同努力，研究生部逐漸形成了“團結、高效、奉獻、開拓”的部風，各項工作都取得了較好的成績：近年來，有多支研究生小分隊被中宣部、團中央授予“三下鄉”先進小分隊;研究生部黨總支被評為校“先進黨組織”;研究生部獲“省高校學生工作先進集體”、校“文明單位標兵”以及“振興東農科技普及活動獎”等榮譽稱號。
隨著研究生招生規模的不斷擴大，我們在基礎條件建設、研究生培養質量、導師隊伍建設、師資力量培養等各個方面都加大了投入，并始終堅持“以質量求生存、以特色求發展”的辦學理念，注重科研創新、人才培養，提高研究生整體素質水平，為積極爭取成立研究生院做準備。