本專業成立于2003年5月，食品科學與遺傳工程研究院與應用化學系、生命科學系、環境工程系聯合組建生物化工專業，配有優秀的師資力量和先進儀器設備，現有教授20人，副教授25人，講師30人，主要研究領域有：食品生物工程，農產品加工工藝，乳制品加工工藝、畜產品加工工藝，動植物細胞培養工程，生物活性物質分離純化工程，生物反應及反應器工程、，海洋生物技術，環境生物工程等。
一、培養目標
按照研究生教育要 “面向現代化、面向世界、面向未來”的要求，培養德、智、體全面發展的社會主義現代化建設所需要的人才。本專業的碩士學位獲得者要求：1）掌握現代生物技術、生物反應器工程、生物分離工程、農產品及食品加工新技術、食品安全檢測與控制等生化工程方面的基礎理論和系統的專門知識，2）掌握本學科的現代實驗技能和計算機技術，熟悉生物工程的研究現狀和發展趨勢，具備進行生物工程、食品工程方面的科學研究的能力和良好的科學道德。3）對外語具有較熟練的閱讀、寫作能力和基本的聽、說能力。培養出具有教學、科研和生產管理能力的高級技術人才。
二、學科專業和研究方向
1．學科專業：生物化工
2．研究方向：
（1） 生物合成與加工工藝
以動物、植物、微生物為主要原料，將基因工程、細胞工程、酶工程等現代生物技術應用于食品工業中，研究開發高科技食品，解決生產中生物技術和工程技術問題，主要研究生物產品的理化性質、功能性質、加工工藝品質與現代加工的新技術、新理論、新材料和新設備，重點研究生物產品深度開發和高效利用技術。
（2） 生物分離工程
對細胞生長動力學、次生代謝產物及生物反應器進行研究。同時進行生物有效成分的高效分離技術與理論的研究，特別是生物活性大分子物質的分離純化及配套技術的研究。
三、課程及論文工作時間
全日制攻讀碩士學位的研究生學習年限一般為2.0年，論文時間不少于1--1.25年；學習課程時間0.75--1.0學年。