復旦大學藥劑學科為國家重點學科，擁有教育部和全軍智能化遞藥重點實驗室。藥劑學科創建于1936年，1986年第一批獲得藥劑學博士學位授予權，是全國最具影響力的藥劑學科之一，整體研究水平處于國內先進行列，部分研究領域處于國際先進行列。
2001年至今，復旦大學藥劑學科承擔和完成了大量科研課題。作為首席科學家單位承擔國家重大科學研究計劃項目1項，負責國家重大新藥創制專項技術平臺1項、“863計劃”項目3項、國家自然科學基金重點和面上課題23項，其他國家及省部級科研課題50余項，國際合作項目4項。發表SCI論文(IF>2.0)160余篇，代表性論文發表于Angew Chem Int EdIT(IF:12.73)、 PNAS (IF:9.77 )、Cancer Research (IF: 8.23)、Biomaterials (IF: 7.88)、J Control Release (IF 7.16) 等國際藥劑學及相關領域的權威與核心期刊。近年來獲得省部級以上獎勵23項，其中：教育部自然科學一等獎1項，上海市科技進步二等獎1項、三等獎2項，中國藥學會科學技術二、三等獎各1項，上海藥學科技一等獎1項、二等獎2項、三等獎2項;申請發明專利110項，已獲得國內外授權40余項;共獲得新藥證書 15項、臨床研究批文28項。由復旦大學藥劑學科主辦的“藥物制劑國際論壇”已成為國內藥劑學界最有影響力的國際會議之一。
復旦大學藥劑學科一直重視研究生的培養和教育工作，先后獲得全國百篇優秀博士學位論文1篇、全國優秀博士學位論文提名論文2篇、上海市優秀博士學位論文3篇、上海市優秀碩士學位論文3篇。除學校的各種獎學金外，藥劑學科還設立了專門針對藥劑學專業研究生的專項獎學金。
藥劑學科培養人才和就業趨勢主要為：在國內外著名企業新藥研發中心、醫藥院校、藥物研究機構、醫院臨床藥學研究中心和藥劑科、藥檢所、藥監局等從事藥物制劑設計、研究與開發及行政監管等工作。