隨著高等教育改革的不斷深入，東北財經大學研究生教育也取得了令人世矚目的成就，自1981年取得碩士學位授予權以來的二十年間為國家輸送了大批博士、碩士等高級經濟管理人才，他們現已成為國民經濟各部門的骨干和中堅。
1986年東北財經大學獲得博士學位授予權，至今已經有二個一級學科博士學位授予權，14個博士學位授權點，23個碩士學位授權點。博士、碩士學位專業跨理論經濟學、應用經濟學、工商管理學、法學、文學等五大學科。
1993年東北財經大學獲得工商管理碩士（MBA）學位授予權，成為全國第一批經國務院學位辦批準的，有權授予工商管理碩士（MBA）學位的26個試點單位之一。在2000年國務學位辦對MBA試點單位的評估過中，我校MBA教育緊隨清華大學名列全國第2位。
學校為研究生教育配備了高檔次的教學與生活設施，如研究生專用的教學樓、專用機房等。
東北財經大學研究生教學與管理以提高教育質量為目的，采取了一系列切實可行的、科學的制度和措施，取得了良好的效果。在1996年遼寧省學位辦組織開展的研究生教學管理檢查評估中，我校獲得了遼寧省研究生教學管理優秀單位稱號；1998年獲遼寧省招生先進單位稱號；2003年，在教育部組織的全國高等學校招生工作評優中，我校研究生招生辦公室工作出色、成績突出，被評為“全國高校招生工作先進集體”。