中國農業大學動物醫學院經過半個多世紀的發展，學院遵循“育天下之英才、解民生之多艱”的指導思想，以培養專業人才為己任，以高新科技為先導，以一流的師資為保障，以傳統獸醫學科為基礎，朝著建設一流研究型獸醫學院闊步前進。
獸醫學為國家重點一級學科，2003年教育部一級學科評估中，我院排名全國第一名;二級學科有基礎獸醫學(解剖與組織胚胎學、家畜生理學、藥理毒理學、病理學)、預防獸醫學(微生物與免疫學、傳染病學、寄生蟲學、實驗動物學)、臨床獸醫學(獸醫臨床診斷學、內科學、外科學、產科學、中獸醫學)，2001年基礎獸醫學和預防獸醫學被評為教育部國家重點學科。獸醫生物醫學和獸醫公共衛生學是2002年新增的研究生教育二級學科。三級學科家畜寄生蟲學與寄生蟲病學1986年、1991年兩次被評為國家重點學科，家畜傳染病學1993年被評為農業部重點學科。
動物醫學院下設基礎醫學系、預防醫學系、臨床醫學系和繼續教育系，設有國家“211工程”重點建設實驗室2個(基礎獸醫學和預防獸醫學)，國家獸藥安全評價中心、國家獸藥殘留基準實驗室、國家動物海綿狀腦病實驗室(含P3實驗室)、國家動物寄生原蟲實驗室、農業部獸藥安全監督檢驗測試中心(北京)、農業部預防獸醫學重點開放實驗室、實驗動物研究所、教學動物醫院，以及中國獸醫雜志編輯部。
學院現有全日制農學博士、碩士學位一級學科授權點和獸醫博士、碩士專業學位授權點，覆蓋了基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學、獸醫生物醫學和獸醫公共衛生學五個二級學科。研究生教育從過去單一的碩士、博士培養模式變為現在的普通碩士、普通博士、碩博連讀、直博和提前攻博(5年)等培養方案。設有獸醫學博士后流動站。