中國農業大學食品科學與營養工程學院由原北京農業大學食品科學系和原北京農業工程大學食品工程系于1995年合并而成，2002年7月前學院一直分東西兩個教學科研區，2002年7月實現實質性融合，學院全部遷往中國農業大學東校區，并更名為中國農業大學食品科學與營養工程學院。
學院下設三個系和四個研究中心，三個系分別是：食品科學與工程系、食品生物技術系和營養與食品安全系；四個中心分別是：葡萄酒研究中心、食品發展戰略研究中心、中日農產品加工研究中心、國家農產品質量監督檢驗檢測中心。學院現有14000平米的實驗辦公大樓，除各教授實驗室外，還有500人報告廳、多媒體會議室、資料室、計算機室、開放實驗室等硬件設備。
學院共有92名教職工，其中教師76人，包括教授19人、副教授28人，正副教授占教師人數62%，教師中從英國、法國、日本、以色列、波蘭、荷蘭和美國回國和國內培養的博士38人，占教師人數50%。
目前學院擁有食品科學和工程一級學科博士學位授予點，設有6個二級學科博士學位授予點和7個碩士點。食品科學和工程在“2003年全國一級學科整體水平評估”中排名第一，農產品貯藏與加工工程為國家級重點學科和農業部重點學科，食品科學為北京市重點學科。現有博士后流動站和企業博士后工作站各一個，此外，全國高等農業院校食品學院（系）院長（主任）聯誼會、中國農學會農產品加工與貯藏分會、中國農業工程學會農產品加工與貯藏分會、中國園藝學會園藝產品采后技術分會和葡萄酒分會均掛靠在我院。
學院現在已形成了本科生教育、研究生教育、成人教育為一體的綜合性教育體系，研究領域涉及畜水產品加工理論與技術，果蔬產品加工、貯運、保鮮理論與技術，糧油食品加工理論與技術，現代農產品加工技術、裝備和品質檢測技術，天然生物活性成分的分離與應用技術，功能食品和新食品資源開發，現代農產品流通理論與產業發展戰略；轉基因食品的理論方法、檢測技術和安全性研究；食品微生物學、發酵工程、食品活性成分的分離技術、生物反應器技術；葡萄的栽培和葡萄酒釀造技術；果蔬食品的采后生理與分子生物學；食品化學、食品營養學和食品安全與質量控制等。學院的宗旨就是立足于解決中國農業、農民和農村的實際需要，倡導多學科之間的融合，為我國農產品的加工業和食品業培養優秀的人才、提供先進的理論和技術。
學院現招收食品科學專業、糧食、油脂與植物蛋白工程專業、農產品加工及貯藏工程專業、食品生物技術專業、營養與食品安全專業的工學博士生、碩博連讀生和碩士生；招收水產品加工專業工學博士生和碩博連讀生及營養與食品衛生學專業醫學碩士生。招收生物工程（食品生物工程方向、葡萄與葡萄酒方向）、食品科學與工程、食品質量與安全專業本科生。2003年招收博士生54名、招收碩士生119名（其中碩博連讀生16名），招收本科生173名。現在校研究生人數377名，其中碩士260名，博士117名，在校本科生1056名。另外學院現招有工程碩士65名，農業推廣碩士97人，成人教育專升本90名。
學院承擔著國家自然科學基金、國家“863”計劃、農業部“948”引進項目、973計劃、國家杰出青年基金、教育部跨世紀優秀人才培養計劃、國家科技攻關、國家教委、科技部、農業部、霍英東基金等資助的科研課題，另外還承擔著企業、部門間的橫向課題和其他多項國際合作
課題。
學院在多年的發展過程中，與許多國內外知名企業和院校形成了良好的合作與交流關系。目前與上海愛普公司、南京雨潤集團、河南雙匯集團、北京匯源集團、新疆屯河集團、英國聯合利華、瑞士雀巢公司、美國普渡大學、美國加利佛尼亞大學戴維斯分校、日本食品綜合研究所、日本國際農林水產業研究中心、荷蘭瓦赫寧根大學等保持著經常而廣泛的交流與合作。