資環學院涵蓋多個學科門類和專業，可授予理學、農學、工學和管理學學位。隨著國家和社會對高層次人才的需求，近幾年招生規模逐漸擴大，目前在校生已有400余人。2003年學院進行了機制改革，成立了4個創新中心，即環境生態過程與調控、資源科學與信息技術、資源與環境工程技術、資源環境戰略與管理。研究生的培養與管理以各中心為載體，實行了新的管理模式。
一、博士點和博士后流動站
學院設有土壤學專業博士點（國家重點學科）、植物營養學專業博士點（國家重點學科）、生態學（北京市重點學科）、環境工程博士點。土壤學專業博士點下設：土壤過程的定量化、土壤水分調控及節水農業、土壤生物與生態農業、土地資源與區域可持續發展、土壤作物系統模擬及精確化管理等5個研究方向，可授予農學博士學位。
植物營養學專業博士點下設：植物營養生理與遺傳、植物根際營養、新型肥料與數字化施肥、養分資源再利用與污染控制、生態環境建設與資源高效利用等5個研究方向，可授予農學博士學位。
生態學專業博士點下設：生態農業與區域發展、農牧生態工程、景觀生態與土地持續利用、綠色食品與有機食品、經濟生態與農業產業化發展等5個研究方向，可授予理學博士學位。
環境工程博士點下設：廢棄物處理與資源化、環境生物技術、污染環境生物修復、綠地設計與城鎮環境建設、設施農業環境控制與清潔生產和環境監測、評價與環境管理等6個研究方向，可授予工學博士學位。
博士點招收學歷教育博士生，接受具有研究生畢業同等學歷的在職人員博士學位申請，授予農學和理學博士學位。學院在本學科點還設有土壤學專業、植物營養學專業博士后流動站，接受國內外博士后進站從事科學研究工作。
二、碩士點
學院包含有土壤學、植物營養學、氣象學、環境工程、環境科學、生態學、土地資源七個碩士點，可授予農學、理學、工學和管理學學位。
土壤學專業下設有土壤水分運動和溶質運移、土壤肥力和土壤化學、農業水資源管理、農業水資源管理、資源環境信息技術。
植物營養專業下設有植物營養生理與遺傳、植物根際營養、新型肥料與數字化施肥、養分資源再利用與污染控制、生態環境建設與資源高效利用。
氣象學專業下設有生物氣象及資源優化利用決策研究、農業微氣候及生物環境儀器研制與應用、生物氣候與資源生態經濟、系統模擬、預測決策與信息技術應用、氣候變化與減災。
生態學專業下設有生態農業與區域發展、農牧生態工程、景觀生態與土地持續利用、綠色食品與有機食品、經濟生態與農業產業化發展等5個研究方向。
環境工程專業下設有廢棄物處理與資源化、環境污染治理與控制、污染控制與有機農業、綠地與環境生態4個研究方向。
環境科學下設環境污染生態與環境化學、環境監測與環境管理、污染物遷移轉化與生物修復、環境生物與環境微生物過程4個研究方向。
土地資源管理專業下設有土地行政管理、土地經濟學、土地資源開發與保護、土地利用規劃、土地信息技術、不動產經營管理。
學院招收學歷教育碩士研究生（含碩博連讀研究生），接受具有研究生畢業同等學歷在職人員的碩士學位申請。
三、專業學位
學院是中國農業大學具備招生碩士專業學位研究生資格的單位之一，目前可招收農業推廣碩士專業學位和公共管理碩士（MPA）專業學位研究生。
·農業推廣碩士專業學位主要為農業技術推廣和農村發展培養高層次應用型、復合型人才，招收對象為具有農業推廣實踐經驗的優秀在職人員。我院碩士點專業均可招收。
·公共管理碩士專業學位培養目標是為政府部門及非政府公共機構培養德才兼備、適應社會主義現代化建設需要的高層次、復合型、應用型公共管理專門人才。我院土地資源管理專業可招收。
·高等學校教師在職攻讀碩士學位是教育部和國務院學位委員會為貫徹黨的十六大“加強教師隊伍建設，提高教師的師德和業務水平”精神，促進高等教育事業發展而新增設的一種學位類型。通過學校推薦報考，參加全國統一安排的入學考試，擇優錄取；入學后參照同專業研究生制訂培養方案，可采取靈活多樣的教學方式；課程考試合格并通過碩士學位論文答辯者，授予相應學科的碩士學位。我院生態學專業、土壤學專業、植物營養專業均可招收研究生。
四、研究生課程進修班
根據國家經濟發展對各類人才的需要，學院還開設環境工程、土地資源管理研究生課程進修班，在北京和外地均有教學點。今后還根據社會的需求開設不同專業的研究生課程進修班。